A Atenção Primária à Saúde (APS), têm papel estratégico no enfrentamento à pandemia causada pelo vírus SARS-CoV-2, enfermidade denominada covid-19. Os atributos reconhecidos em âmbito internacional e nacional que norteiam as ações da APS são: acesso de primeiro contato, vínculo longitudinal, integralidade, coordenação da atenção e ainda, a orientação familiar, a orientação comunitária e competência cultural. O fortalecimento de tais atributos, pela gestão local e as equipes multiprofissionais, com definição de fluxos e protocolos que estabeleçam o cuidado em saúde em todos os pontos da rede de atenção à saúde, possibilita a prevenção e controle clínico-epidemiológico da epidemia por covid-19. Desde o início da epidemia, no município de Niterói (RJ), iniciou-se um processo de organização dos fluxos de atendimentos nas unidades de saúde e discussão com as equipes multiprofissionais sobre os protocolos e processo de trabalho, a fim de garantir o acesso as pessoas com suspeita de covid-19, a continuação do cuidado dos grupos prioritários, a vigilância em saúde no território, e o cumprimento das normas de segurança para o trabalhador em saúde, seguindo as regulamentações do uso de EPI vigentes. Este relato traz a experiência das práticas em educação em saúde desenvolvidas pela equipe de supervisão do Programa Médico de Família (PMF) da Regional Norte 1, do município de Niterói, tendo como público alvo as 17 equipes de saúde que compõem este território. Diante da complexidade na organização dos fluxos e processos de trabalho nos serviços de saúde, as mudanças de protocolos, e o aporte emocional dado aos profissionais de saúde, a equipe de supervisão do PMF elaborou oficinas para discutir os eixos estratégicos para o enfrentamento da epidemia nos territórios. Estas oficinas tiveram como objetivo: acolher os profissionais de saúde, suas percepções e sentimentos sobre este momento.